Warum schneiden die meisten Restriktionsenzyme in der palindromischen Sequenz ab?

Warum schneiden die meisten Restriktionsenzyme in der palindromischen Sequenz ab?
Anonim

Antworten:

Weil es effizienter ist.

Erläuterung:

Enzyme wie Restriktionsenzyme müssen eine sehr spezifische Sequenz erkennen, um ihre Aufgabe erfüllen zu können. Es bindet nur in einer bestimmten Konfiguration an die DNA. Glücklicherweise! weil Sie keinen Pacman wollen, der DNA an zufälligen Stellen schneidet.

DNA ist doppelsträngig und hat daher zwei Seiten, an die sich das Enzym binden kann. Eine palindrome Sequenz ist auf beiden Seiten gleich vor und zurück (siehe Abbildung unten). Dies bedeutet, dass das Enzym die Sequenz unabhängig davon erkennt, von welcher Seite sich das Enzym der DNA nähert.

Eine palindrome Sequenz erhöht auch die Chance, dass beide DNA-Stränge geschnitten werden. Es ist sogar möglich, dass zwei Enzyme als Dimer wirken, um die palindrome Sequenz zu schneiden, wodurch die Effizienz weiter gesteigert wird.

Der letzte Grund war im Kampf zwischen Viren und Bakterien wichtig. Bakterien haben sich entwickelt, um auf Bakterien abzielende Viren (Bakteriophagen) mithilfe von Restriktionsenzymen zu "deaktivieren", die an diese palindromen Sequenzen binden. Das Schneiden beider DNA-Stränge schadet dem Virus mehr als das Schneiden eines Strangs.